在代欧奇希斯与裂空坐持续激战之时,拉鲁斯市广播系统呼吁民众紧急避难,市民们惊慌疏散。小超在避难时遇到一只求救的正电拍拍,它的同伴负电拍拍被困在垃圾桶里,小超帮忙时却被突然出现的小卡比兽吓昏。小智赶来唤醒小超后,一行人来到玻璃温室植物园躲避。在植物园里,小超讲述了四年前代欧奇希斯从陨石中出现,与裂空坐大战并被轰碎的经历。此时,代欧开始复制“影子代欧”分身,掳走市民。小智等人在植物园里与影子代欧展开战斗,之后又外出寻找食物,期间遭遇诸多危险。后来他们得知代欧奇希斯的另一部分身体——水晶球体被伦多博士的助手春野带走,而代欧正是为了找回球体才返回攻击。最后,小超决定成为代欧的朋友,大家一起帮助他平息裂空坐与代欧之争。