据说基拉祈一千年才会醒来一次,吸收千年彗星的力量反哺大地,使法恩斯成为圣地。但在这次苏醒前夕,魔术师巴特勒与女友黛安将包裹基拉祈的结晶发掘并带走。小智一行人为观看千年彗星前往举办庆典的游乐场,却发现是片荒地,便在此露营。深夜,车队惊醒众人。小遥买了“圆梦之星”挂饰,据说在能看见彗星的七天里每晚默念愿望并折一角,第七晚愿望会达成。小智和小胜意外成了巴特勒的幸运观众,巴特勒将结晶托付给小胜,结晶随后变成基拉祈。原来巴特勒是岩浆团成员,想利用基拉祈的能量复活超古代神奇宝贝固拉多。预见危险的阿勃梭鲁带领众人赶回法恩斯。巴特勒夺走基拉祈实施计划,创造出假固拉多,将法恩斯化为荒芜。戴安被吞没时,巴特勒醒悟,在小智与小胜帮助下终止进程,假固拉多消逝。基拉祈重新吸收能量后陷入千年沉睡,小遥虽忘了折最后一角,但坚信愿望会成真。